中心成立于2003年1月，是市衛(wèi)生健康委直屬的公益一類事業(yè)單位，副處級建制，為實施疾病預防控制職能的公共衛(wèi)生核心專業(yè)機構(gòu)。2018年，“揚州市公共衛(wèi)生中心異地新建”是市委、市政府確定民生工程和重大項目之一，歷經(jīng)2年多的建設，2020年12月29日，揚州市公共衛(wèi)生中心建成并全面啟用。中心由市疾病預防控制中心、市血地防辦、市醫(yī)學檢驗中心、12320管理中心等多部門組成，增掛“江蘇省公共衛(wèi)生研究院揚州分院”“全省公共衛(wèi)生醫(yī)師規(guī)范化培訓揚州基地”牌子。新中心用地面積29畝，建筑面積2.8萬㎡，其中實驗室面積超過1萬㎡，項目總投資3.8億。中心設23個科室，主要職能包括承擔全市疾病預防控制、環(huán)境與職業(yè)健康、疾病病原生物檢測鑒定、放射衛(wèi)生和學校衛(wèi)生、健康教育與促進、疾控體系信息化建設等工作；開展突發(fā)公共衛(wèi)生事件調(diào)查、處置以及食品安全事故流行病學調(diào)查，對重大公共衛(wèi)生問題進行風險評估；建立與醫(yī)療機構(gòu)醫(yī)防協(xié)同機制，指導基層醫(yī)療機構(gòu)開展基本公共衛(wèi)生服務。